Современные системы экологического мониторинга представляют собой сложные информационно-управляющие комплексы, оперирующие с большими объемами информации. Способы организации информационного обеспечения в таких системах составляют фундаментальную проблему. На основе анализа особенностей различных видов документооборота систем экологического мониторинга предлагается кластерный подход к построению архитектуры хранилища документальной информации.