В работе предложена модель слабо сжимаемой среды в трехмерной области для решения задач течений в условиях городской застройки. На основе методики КАБАРЕ построена консервативная конечно-разностная схема уравнений Навье-Стокса с уравнением состояния слабо сжимаемой среды в изотермическом приближении. Проведена верификация численной схемы на тестовом примере А1-1 из базы тестов проекта CEDVAL Метеорологического Института Университета Гамбурга. Получены статистические данные сравнения по осредненным полю скорости в контрольных сечениях с экспериментальными данными.