Переход к новой парадигме научных исследований, базирующейся на сборе, обработке и анализе данных, требует проведения комплекса взаимосвязанных работ в области нанотехнологической информатики – новом направлении в науке. Обсуждается ряд проектов, выполненных в области нанотехнологической информатики в мире и в Российской Федерации. Приведены критические области, требующие проведения первоочередных исследований в области нанотехнологической информатики.