Биоинформатика и поиск сдвигов рамки считывания в генах

    М.А. Короткова, Е.В. Коротков

    Аннотация

    Введено понятие сдвига фазы триплетной периодичности (ТП) нуклеотидной последовательности. Разработан математический алгоритм для выявления сдвига фазы триплетной периодичности в нуклеотидных последовательностях. Были получены последовательности генов из банка данных Kegg-46 и выявлены 27417 тысяч генов (0,7% от общего их числа в базе данных Kegg), где был обнаружен сдвиг фазы триплетной периодичности. Мы предполагаем, что сдвиг фазы трипелтной периодичности связан со сдвигами рамки считывания в генах.

    Ключевые слова

    триплетная периодичность, открытая рамка считывания, сдвиги